1940 Prediger Friedrich Eckhardt stirbt nach arbeits- und segensreichem Leben am 9. September.

1945 Bei einem Luftangriff am 24. März wird der Gemeinschaftssaal völlig zerstört. Durch zeitbedingte Schwierigkeiten (Nationalsozialismus, Frontdienst der Männer, Luftangriffe) und den Verlust des Saales geht die Zahl der Mitglieder stark zurück.

EC im Blau-Kreuz-Haus

1933 Anstellung von Gemeindeschwester Anna Brandt aus der Frauenmissionsschule Bibelhaus Malche in Freienwalde.

1938 Das gute Verhältnis zwischen dem Blau-Kreuz-Verein und der Landeskirchlichen Gemeinschaft Immanuel wird getrübt. Die Blau-Kreuz-Hauptstelle in Barmen übernimmt das Führerprinzip und strebt eine zentralistische Leitung an. Heinrich Gausmann, der als derzeitiger stellvertretender Vorsitzender wegen Erkrankung von Pastor Ites die Geschäfte leitet, wird zum Rücktritt aufgefordert. Gemeinschaft und EC ziehen aus dem Blau-Kreuz-Haus aus und finden Aufnahme im Lutherhaus (Gemeindehaus der St.-Katharinen-Kirche).

1939 Die Gestapo löst den CVJM auf. Sein Sekretär, Helmut Hass, wird von der Gemeinschaft für den 1932 erkrankten und 1937 gestorbenen Prediger von Mosch als Gemeinschaftsprediger übernommen. Mehrere CVJM-Mitglieder, unter ihnen Friedrich Kimmel und Hermann Kock, schließen sich der Gemeinschaft an.

1939 bis 1945 Ein großer Teil der männlichen Mitglieder wird zum Heeresdienst eingezogen, darunter auch Prediger Hass. Die Arbeit in der Gemeinschaft wird durch die Gestapo und durch Kriegsereignisse erschwert. Sie verläuft in stiller, aber doch fruchtbarer Weise. Ihrem Selbstverständnis einer Landeskirchlichen Gemeinschaft treu, übernimmt die Gemeinschaft zahlreiche kirchliche Dienste. Insbesondere Heinrich Gausmann, H. Schwägler und H. Schweppe predigen jahrelang im Osnabrücker Land in Gottesdiensten verschiedener lutherischer, reformierter und unierter Kirchen, deren Pastoren zum Kriegsdienst eingezogen worden waren. Das Lutherhaus muss wegen Kohlenmangels zeitweilig geschlossen werden. In einer Bombennacht des Jahres 1942 wird der Saal des Lutherhauses ein Raub der Flammen. Versammlungen der Gemeinschaft werden vorübergehend in Privaträume in der Nachbarschaft verlegt.

1919 Pastor Bell von der St.-Katharinen-Kirche gründet mit Gemeindegliedern die "Friedensgemeinschaft". Ihre Bibelstunden finden im "Evangelischen Vereinshaus" an der Seminarstraße statt. Junge Menschen dieses Kreises haben den Wunsch, unter sich zusammenzukommen. Sie gründen einen "Jugendbund für entschiedenes Christentum" - neben dem an der Langen Straße der zweite EC-Jugendbund in Osnabrück. Vorsitzender wird Schneidermeister August Pellmann. Anfänglich finden die Versammlungen im Wohnzimmer der Familie Landwehr, Adolfstraße, später im Haus Bethanien, Dielinger Straße (Heim der Marburger Schwestern), schließlich im Blau-Kreuz-Haus statt.

Mit der Gemeinschaft Immanuel zieht dieser EC später in das Lutherhaus um. Zwar durch die Zeitumstände stark geschrumpft, geht doch die EC-Arbeit auch in den Kriegsjahren in Stille und Treue weiter. Besonders erwähnenswert ist die Betreuung junger, in Osnabrück stationierter Wehrmachtsangehöriger durch die Familie Pellmann. In ihrem Haus findet auch regelmäßig die Soldaten-Bibelstunde unter Beteiligung verschiedener Dienstgrade statt.

Etwa 1920 Aus dem "Komm-Mit-Verein" im Haus Bethanien, Dielinger Straße, bildet sich eine zunächst kleine Gemeinschaft unter der Leitung einer Marburger Schwester. Im Hause Johannisstraße 73 weitet sich dieser Zweig der Gemeinschaftsarbeit aus, auch entwickelt sich eine kleine EC-Jugendbundarbeit. Wegen räumlicher Enge mietet die Gemeinschaft eine Etage mit Saal und Schwesternwohnung im Hause Karl Tiemann, Johannisstraße 100. In Treue wird die Frohe Botschaft weitergegeben; im besonderen geschieht dies durch die "Schriftenmission".

Das Gebäude mit den Gemeinschaftsräumen fällt einem Bombenangriff zum Opfer. Im Hause der Familie Steinkamp, Uhlandstraße, findet der geschrumpfte Kreis Unterschlupf, und Diakonie-Schwester Helene Gruhlke erhält dort einen Wohnraum. Einzelne größere Versammlungen kann der Kreis in der Bergkirche und in der Kantine der Firma Karmann, Martinistraße, durchführen.

1948 Der begonnene Wiederaufbau des Gemeinschaftshauses kommt durch die Währungsreform in Gefahr. Am 18. Oktober stirbt der Vorsitzende Heinrich Gausmann. Konrad Pegel wird zu seinem Nachfolger gewählt.

1950 Nach ungewöhnlichen Opfern an Geld, Zeit und Arbeitseinsatz der Mitglieder kann der erste Bauabschnitt (Kleiner Versammlungssaal sowie Hausmeister– und Schwesternwohnräume im Dachgeschoss) vollendet werden.

1952 Der Jugendbund errichtet im verbliebenen Teil der Ruine eine Nissenhütte mit großem Versammlungsraum und zwei Gruppenräumen.

1960 Der zweite Bauabschnitt wird vollendet. Nunmehr stehen auch der große Saal und zwei Jugendbundräume zur Verfügung.